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MDT-Pu04-琼脂糖凝胶回收 PCR产物纯化试剂盒(柱式法)

【预期用途】用于小提中量质粒的快速提取。【检验原理】 裂解含质粒的细菌,在试剂高盐低pH的环境下,吸附柱内的硅胶膜高效吸附分离的质粒DNA;洗涤吸附柱,去除蛋白...


商品详情

补充信息

【预期用途】

用于琼脂糖凝胶中DNA片段(<10kb)的回收及PCR扩增产物中DNA片段的纯化。

 

【检验原理】

溶胶缓冲液溶解琼脂糖凝胶。在高盐低pH值的环境下,吸附柱内的硅胶膜高效吸附DNA;洗涤吸附柱,去除痕迹琼脂糖、盐、引物等杂质;在洗脱液低盐高pH值的情况下,硅胶膜释放吸附的DNA,从而达到快速回收纯化DNA的目的。

 

【试剂盒组成、贮藏及有效期】

产品编号

试剂名称

50T

100T

200T

MDT-Pu04  

溶胶缓冲液

30mL×1

60mL×1

120mL×1

RAW1缓冲液

12mL×1

24mL×1

48mL×1

AW2缓冲液

6mL×1

12mL×1

24mL×1

吸附柱(含收集管)

50

100

200

洗脱液B

5mL×1

10mL×1

20mL×1

3M乙酸钠

0.5mL×1

1mL×1

2mL×1

使用说明书

1

1

1

所有成分:常温(10-30℃)运输保存,有效期1年。


 

【注意事项】使用前务必认真阅读以下注意事项

1.提前配制RAW1,RAW1中乙醇含量低于60%会影响提取效果。

2.提前配制AW2,AW2中乙醇含量低于80%会影响提取效果。

3.溶胶缓冲液包含pH指示剂,其在pH≤7.5时为黄色,缓冲液在较高pH下为橙色或紫色。吸附柱对DNA的吸附仅在pH≤7.5时有效,吸附最佳pH在5.0至7.0之间。

4.本试剂盒在有效期内不同批号试剂可以互换。

5.虽然本产品无氯仿、苯等OSHA规定的危险物品,但操作时最好做好必要的防护措施,带口罩手套,并且在通风的生物安全柜中进行。

6.按当地法律法规处理生物样本和废弃物。

 

【样本要求】

含目标DNA片段(<10kb)的琼脂糖凝胶;PCR扩增产物。

 

自备器械和试剂】

型高速离心机(最大离心力12,000×g)、振荡恒温金属浴、1.5mL离心管、无水乙醇和异丙醇

l  RAW1配制:RAW1缓冲液使用前按照瓶身标签说明加入相应量的无水乙醇,使乙醇含量为60%,混匀后密封常温保存。

l  AW2配制:AW2缓冲液使用前按瓶身标签说明加入相应量的无水乙醇,使乙醇含量为80%,混匀后密封常温保存。


【样本处理】

一、琼脂糖凝胶

1.选择干净锋利的刀片,在紫外灯下(注意防护),从琼脂糖凝胶中切取目的DNA条带。


Ø要最大限度地去除多余的琼脂糖。

 

2.将凝胶放入干净的1.5mL离心管中,称重。加入3倍体积的溶胶缓冲液(100mg的琼脂凝胶等于100μL体积的溶液)。


Ø每100mg凝胶加入300μL溶胶缓冲液。对于> 2%琼脂糖凝胶,加入5倍体积的溶胶缓冲液。

Ø每个吸附柱加入的最大凝胶量为400mg,对于> 400mg的凝胶,使用多个吸附柱

 

3.在60℃下1,500rpm振荡孵育(或60℃孵育过程中手工振荡4-5次)至凝胶完全溶解(大约5分钟)。


Ø确保琼脂糖凝胶完全溶解。

 

4.凝胶完全溶解后,检查混合液的颜色是否为黄色(类似于溶胶缓冲液的颜色)。如果混合液的颜色是橙色或紫色,加入10μL的3M乙酸钠混匀,使混合液的颜色变为黄色。


5.向混合液中加入1倍凝胶体积的异丙醇,吹打混匀。比如:100mg琼脂糖凝加入100μL异丙醇。


ØPCR产物片段小于100bp 片段时,加入1.5倍凝胶体积的异丙醇。比如,100mg的琼脂糖凝加入150μL异丙醇。

Ø异丙醇加入量过多影响提取效率。

Ø加入异丙醇后不能离心样品。

 

二、PCR产物

1.在1.5mL离心管中加入PCR产物和5倍PCR产物体积的溶胶缓冲液,混匀。比如:50μL PCR产物加入250μL溶胶缓冲液。


2.检查混合液的颜色是否为黄色(类似于溶胶缓冲液的颜色)。如果混合液的颜色是橙色或紫色,加入10μL的3M乙酸钠混匀,使混合液的颜色变为黄色。


3.向混合液中加入2倍PCR产物体积的异丙醇,吹打混匀。比如50μL PCR产物加入100μL异丙醇。


Ø PCR产物片段小于100bp 片段时,加入3倍PCR产物体积的异丙醇。


【操作步骤】

1.将吸附柱放入收集管中,转移全部液体至吸附柱。


Ø吸附柱一次最大容量为800μL,对于体积超过800μL的样品分批加入

2.闭盖12,000×g离心1分钟。吸弃废液,将吸附柱重新放入收集管中。


3.开盖,在吸附柱中加入600μL RAW1,闭盖12,000×g离心20秒。吸弃废液,将吸附柱重新放入收集管中。 


Ø加入RAW1时,避免RAW1接触吸附柱的管口。

 

4.开盖,在吸附柱中加入600μL AW2,闭盖12,000×g离心20秒。取出吸附柱,丢弃收集管,将吸附柱放入新的1.5mL离心管中。


5.闭盖12,000×g离心3分钟。取出吸附柱,丢弃离心管。


6.将吸附柱放入新的1.5mL离心管中,加入50µL洗脱液B至吸附柱中心,闭盖。室温静置3分钟,12,000×g离心1分钟,收集洗脱液,备用。


Ø洗脱液B的使用量可以根据需要调整,但不得少于30µL

Ø洗脱液的使用量太少会影响提取效果。


常见问题

原因

解决方案

吸附柱堵塞

凝胶未完全溶化

提高溶胶温度、延长溶胶时间、增加溶胶过程中的摇晃次数,仔细检查确保无固体琼脂糖残留。

回收/纯化产量低

1. 电泳液时间过长,导致电泳液pH偏碱,因此琼脂糖凝胶溶解后的颜色为橙色或紫色,并且未对pH值进行校正。

更换电泳液;加入10μL的3M乙酸钠混匀,使混合液的颜色变为黄色(类似于溶胶缓冲液的颜色)。

2、凝胶未完全溶化

提高溶胶温度、延长溶胶时间、增加溶胶过程中的摇晃次数,仔细检查确保无固体琼脂糖残留。

3. 回收/纯化片段过小

小于或等于100bp片段时,增加异丙醇的使用量。

4. PCR产物电泳时上样体积较小,目标条带的核酸总量较少。

使用体积较大的电泳孔,增加PCR产物的上样量。

5. RAW1中乙醇添加比例不当。

使用无水乙醇配制RAW1,使乙醇含量达60%。

6. AW2中乙醇添加比例不当。

使用无水乙醇配制AW2,使乙醇含量达80%。

7.洗脱不当

洗脱液加至膜中央,适当减少洗脱体积,可65°C预热、延长室温放置时间或者进行二次洗脱。

纯度低

1.盐离子残留

避免RAW1接触吸附柱上下口;增加1次AW2洗涤。

2.琼脂糖残留

尽可能去除不含目的片段的琼脂糖,提高溶胶温度、延长溶胶时间、增加溶胶过程中的摇晃次数,仔细检查确保无固体琼脂糖残留。

3.乙醇残留

最后一次洗涤后,吸附柱闭盖12,000×g再离心3分钟。


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