MDT-Pu02-1-琼脂糖凝胶回收试剂盒(柱式法)
【预期用途】
用于琼脂糖凝胶中DNA片段(<10kb)的纯化。
【检验原理】
溶胶缓冲液充分溶解琼脂糖凝胶,释放DNA。在溶胶缓冲液高盐低pH值的环境下,吸附柱内的硅胶膜高效吸附释放的DNA;洗涤吸附柱,去除痕迹琼脂糖、盐等杂质;在洗脱液低盐高pH值的情况下,硅胶膜释放吸附的DNA,从而达到快速回收DNA的目的。
【试剂盒组成、贮藏及有效期】
产品编号 | 组成成分 | 50T | 100T | 200T |
MDT-Pu02-1 | 溶胶缓冲液 | 30mL×1瓶 | 60mL×1瓶 | 120mL×1瓶 |
RAW1缓冲液 | 12mL×1瓶 | 24mL×1瓶 | 48mL×1瓶 | |
AW2缓冲液 | 6mL×1瓶 | 12mL×1瓶 | 24mL×1瓶 | |
吸附柱(含收集管) | 50支 | 100支 | 200支 | |
洗脱液B | 3mL×1瓶 | 6mL×1瓶 | 15mL×1瓶 | |
3M乙酸钠 | 0.5mL×1支 | 1mL×1支 | 2mL×1支 | |
说明书 | 1份 | 1份 | 1份 |
所有试剂:常温(10-30℃)运输保存。有效期1年。
【注意事项】使用前务必认真阅读以下注意事项
1. 提前配制RAW1,RAW1中乙醇含量低于60%会影响提取效果。
2. 提前配制AW2,AW2中乙醇含量低于80%会影响提取效果。
3. 溶胶缓冲液包含pH指示剂,其在pH≤7.5时为黄色,缓冲液在较高pH下为橙色或紫色。吸附柱对DNA的吸附仅在pH≤7.5时有效,吸附最佳pH在5.0至7.0之间。
4. 本试剂盒在有效期内不同批号试剂可以互换。
5. 虽然本产品无氯仿、苯等OSHA规定的危险物品,但操作时最好做好必要的防护措施,带口罩手套,并且在通风的生物安全柜中进行。
6. 按当地法律法规处理生物样本和废弃物。
【样本要求】
含目标DNA片段(<10kb)的琼脂糖凝胶。
【自备器械和试剂】
小型高速离心机(最大离心力≥12,000×g)、振荡恒温金属浴、1.5mL离心管、无水乙醇和异丙醇等。
l RAW1配制:RAW1缓冲液使用前按照瓶身标签说明加入相应量的无水乙醇,使乙醇含量为60%,混匀后密封常温保存。
l AW2配制:AW2缓冲液使用前按照瓶身标签说明加入相应量的无水乙醇,使乙醇含量为80%,混匀后密封常温保存。
【标准操作步骤】
1.选择干净锋利的刀片,在紫外灯下(注意防护),从琼脂糖凝胶中切取目的DNA条带。
Ø要最大限度地去除多余的琼脂糖。
2.将凝胶放入干净的1.5 mL离心管中,称重。加入3倍体积的溶胶缓冲液(100mg的琼脂凝胶等于100μL体积的溶液)。
Ø每100mg凝胶加入300μL溶胶缓冲液。对于>2%琼脂糖凝胶,加入5倍体积的溶胶缓冲液。
Ø每个吸附柱加入的最大凝胶量为400mg,对于>400mg的凝胶,使用多个吸附柱。
3.在60℃下1,500rpm振荡孵育(或60℃孵育过程中手工振荡4-5次)至凝胶完全溶解(大约5分钟)。
Ø确保琼脂糖凝胶完全溶解。
4.凝胶完全溶解后,检查混合液的颜色是否为黄色(类似于溶胶缓冲液的颜色)。如果混合液的颜色是橙色或紫色,加入10μL的3M乙酸钠混匀,使混合液的颜色变为黄色。
5.向混合液中加入1倍凝胶体积的异丙醇,吹打混匀。例如,100mg琼脂糖凝,加入100μL异丙醇。
Ø异丙醇加入量过多影响提取效率。
Ø加入异丙醇后不能离心样品。
6.将吸附柱放入收集管中,转移全部液体至吸附柱。
Ø吸附柱一次最大容量为800μL,对于体积超过800μL的样品分批加入。
7.闭盖12,000×g离心1分钟。吸弃废液,将吸附柱重新放入收集管中。
8.开盖,在吸附柱中加入600μL RAW1,闭盖12,000×g离心20秒。吸弃废液,将吸附柱重新放入收集管中。
Ø加入RAW1时,避免RAW1接触吸附柱的管口。
9.开盖,在吸附柱中加入600μL AW2,闭盖12,000×g离心20秒。取出吸附柱,丢弃收集管。
10.将吸附柱放入新的1.5mL离心管中。闭盖12,000×g离心3分钟。取出吸附柱,丢弃离心管。
11.将吸附柱放入新的1.5mL 离心管中,加入50µL洗脱液B至吸附柱中心,闭盖。室温静置3分钟,12,000×g离心1分钟,收集洗脱液,备用。
Ø洗脱液B的使用量可以根据需要调整,但不得少于30µL。
常见问题 | 原因 | 解决方案 |
吸附柱堵塞 | 凝胶未完全溶化 | 提高溶胶温度、延长溶胶时间、增加溶胶过程中的摇晃次数,仔细检查确保无固体琼脂糖残留。 |
回收产量低 | 1.电泳液时间过长,导致电泳液pH偏碱,因此琼脂糖凝胶溶解后的颜色为橙色或紫色,并且未对pH值进行校正。 | 更换电泳液;加入10μL的3M乙酸钠混匀,使混合液的颜色变为黄色(类似于溶胶缓冲液的颜色)。 |
2.凝胶未完全溶化 | 提高溶胶温度、延长溶胶时间、增加溶胶过程中的摇晃次数,仔细检查确保无固体琼脂糖残留。 | |
3.回收片段过小 | 小于或等于100 bp 片段时,加入1 .5倍体积的异丙醇。 | |
4.PCR产物电泳时上样体积较小,目标条带的核酸总量较少。 | 使用体积较大的电泳孔,增加PCR产物的上样量。 | |
5.RAW1中乙醇添加比例不当。 | 使用无水乙醇配制RAW1,使乙醇含量达60%。 | |
6.AW2中乙醇添加比例不当。 | 使用无水乙醇配制AW2,使乙醇含量达80%。 | |
7.洗脱不当 | 洗脱液加至膜中央,适当减少洗脱体积,可65°C预热洗脱液、延长室温静置时间或者进行二次洗脱。 | |
纯度低 | 1.盐离子残留 | 避免RAW1接触吸附柱上下口;增加1次AW2洗涤。 |
2.琼脂糖残留 | 尽可能去除不含目的片段的琼脂糖,提高溶胶温度、延长溶胶时间、增加溶胶过程中的摇晃次数,仔细检查确保无固体琼脂糖残留。 | |
3.乙醇残留 | 最后一次洗涤后,吸附柱闭盖12,000×g再离心3分钟。 |



